P2P在商业方面带来的挑战是全方位的，涉及内容提供商、应用/业务提供商和网络提供商等多个环节。
1）对内容商而言，基于P2P技术的下载使得盗版猖獗。BT、EDonkey等下载工具的广泛应用，直接冲击了内容商的利益。内容商的图书、音乐、影像制品的销量，早就已经随着互联网的普及，呈现逐年下降的趋势，而P2P下载业务的兴起无异于给他们的又一重大打击，甚至连非法的盗版光盘市场也因P2P类下载而日益萧条。
2）目前基于P2P应用和业务的运营，绝大多数应用均是免费的，没有足够的利润空间和合理的利润分配模式来支持P2P应用和业务的开发商和服务提供商，能够持续而良性的发展。这和互联网上其它很多业务和应用，面临没有合理的商业模式的窘境是一样的，几乎只能依靠广告和发现投资生存。
3）P2P对承载网提出了更高的要求，用户时时在线、上下行带宽对称、带宽需求增加使得网络流量模型发生了变化，引起了网络运营商的极大恐慌。P2P类应用的流量已经占据了40－70%的网络带宽，严重影响了其他所有业务和应用的服务质量。更可怕的是无论网络运营商如何扩容，所倍增加的带宽往往会在短短的两周左右被占满。带宽似乎永远不够，任何的网络扩容都失去了意义，严重的打击了网络运营商升级改造的积极性。
4）还有一些P2P应用对于现有运营商的业务造成冲击，如Skype电话对传统语音电话市场的蚕食，使得运营商的利润下滑，这些带来了网络运营商的更大的抱怨。